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| 本文作者: 李雨晨 | 2020-12-07 20:10 |
作為DeepMind的核心“王牌”,Alpha系列絕不僅是挑戰圍棋和游戲而生。
盡管AlphaGo曾在國際象棋、圍棋等項目中取得了超越人類的表現,其研究不僅震驚世界,也兩次登上 Nature。
但是,正如DeepMind首席執行官Hassabis所言:
“我們的目標從來就不只是贏得圍棋,而是開發能夠解決蛋白質折疊這類問題的算法。對于我們來說,這真的是一個關鍵時刻。這個項目就像燈塔,這是我們關于人和資源的首次重大投資,用于解決一個根本性的、現實世界的重要問題。
AlphaFold就是在這樣的背景下誕生,而且從第一天起,就立志挑戰生物學里的最難問題——蛋白質折疊。
經過整整兩年的,Hassabis這番豪言,如今終于應驗。
然而,“將會改變一切”的AlphaFold2,現階段畢竟還是一項“競賽成果”,而AI的本質還是要落到更為具體的細分行業中,要面臨諸多的學科研究和產業轉化問題。
在這個過程中,AlphaFold2還有哪些值得我們進一步思考的地方?生物結構學有沒有可能分化出新的細分領域?
因此,我們為AlphaFold2準備了產學兩界最為關注的七大疑問,看完這七大疑問和20多個子問題,你將會認識到一個全新的AlphaFold2和充滿探索前景的生命學科。
1、CASP競賽的目的、歷史
2、AlphaFold2的“勝利”具體體現在哪些項目上?
3、除了AlphaFold2之外,這次CASP競賽還有哪些亮點?
1、蛋白折疊預測的主要意義和應用是什么?主要難點是什么?
2、AlphaFold2主要在哪些技術問題上取得了突破?在哪些主要問題上還沒有?是否能區分alternative confirmation,能否區分monomer、dimer等?
3、AlphaFold2的“勝利”不是天上掉下來的,它在算法、數據上都借鑒了此前的哪些主要結果和方法?華人科學家在中間都有哪些主要貢獻?
1、結構生物學的哪些方向能受益而加速突破?哪些方向會收影響而淡出?
2、結構生物學的研究能夠怎樣幫助AlphaFold2進一步改進?
1、AlphaFold2能否擴展到分子動力學MDS領域?
2、能否應用于蛋白-配體相互作用/對接, 蛋白質-蛋白質相互作用?
3、能否應用于蛋白質設計?
1、這個突破對實際應用尤其是藥物開發的影響、意義是什么?短期能見效嗎?藥廠是不是會開始組建這方面的AI團隊?
2、除了藥物研發,AlphaFold2還可能在哪些方面有應用?
3、這個突破可能帶來哪些新的商業和創業機會?有沒有可能分化出新的細分領域?
1、AlphaFold2算法的成功主要得益于機器學習,深度學習中的哪些重要技術和突破(例如注意力機制)?如果僅靠增加算力能否進一步突破?
2、AlphaFold2算法當前的局限性在哪里?可能有哪些改進空間?
1、 如果AlphaFold 不開源,學術界有沒有成立開源組織的計劃?
2、工業界一些大公司在算法和算力方面都占有絕對優勢,那么學術研究前進的方向在哪里?對于高校中的AI研究人員有什么建議?對于生物研究人員有什么建議?
3、工業界一些大公司在算法和算力方面都占有絕對優勢,對整個學術界的影響會是什么?如何“擺正”學術界和工業界的關系?
12月8日上午9:30-11:00,由圖像計算與數字醫學國際研討會(ISICDM)主辦,雷鋒網、醫療AI掘金志協辦的《ISICDM-AI+蛋白質結構預測》主題論壇,將正式在線上開啟。
主題:權威專家談AlphaFold:DeepMind 到底突破了什么?
時間:12月8日,上午9:30-11:00
主辦單位:圖像計算與數字醫學國際研討會(ISICDM)
協辦單位:雷鋒網、醫健AI掘金志
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